12月25日，央视新闻频道报道称，央视记者联合水环境国家模拟重点实验室——北京师范大学水科院调查发现，河流中抗生素含量惊人，甚至在南京居民家中的自来水也有抗生素检出。但实际上，抗生素并不是水中应有的物质。
今年10月底到11月初，央视记者和研究人员分赴我国东北、华北和华东等地，在一些饮用水源地、排水明渠、制药企业、畜禽养殖场周边采集水样，通过实验室检测，这些水样中都有抗生素被检出。其中，在沈阳抗生素厂附近，6-氨基青霉烷酸含量达到178纳克/升，氨苄西林168纳克/升，阿莫西林也在113纳克/升以上。
水中的抗生素主要来源于哪里？央视记者对全国几大抗生素基地生产污水以及周边水域的水样分析以后发现，抗生素含量惊人，尤其是位于山东省济宁市的鲁抗医药股份有限公司偷排污水，在其外排污水中，抗生素含量达到了53000纳克/升，它是全国四大抗生素厂之一，经央视记者调查，该公司存在涉嫌违法排污和数据造假等问题。当地的群众举报称，总是闻到附近的老运河河水里有浓重的药味。
在央视曝光后，环保部向媒体发布消息称，责成山东省环境保护厅调查处理，并派环境保护部华东环境保护督查中心人员一同赶赴现场调查。环境保护部要求山东省环境保护厅全面调查相关情况，依法处理处罚环境违法行为，严肃追究相关人员责任，督促企业整改到位，及时公开有关调查处理情况。
北京师范大学水科院副院长王金生称，“这样的含量还是比较让人吃惊的，说明地表水体受抗生素影响比较大”。据他介绍，全国主要河流，如辽河、海河、长江入海口、珠江都检出了抗生素。
其中，珠江广州段抗生素脱水红霉素含量高达460纳克/升，磺胺嘧啶209纳克/升，磺胺二甲基嘧啶184纳克/升，远远高出了欧美发达国家规定的100纳克/升的含量，由于许多江河是居民的应用水源，居民家中的自来水也被检出含有抗生素。
在南京市鼓楼区，记者对居民家中的自来水进行取样发现，阿莫西林含量为8纳克/升，6-氨基青霉烷酸含量为19纳克/升。
事实上，自来水中检出抗生素并非首次。安徽农业大学资源与环境学院曾对滁州、安庆、阜阳、铜陵、蚌埠等地部分水体进行过调查，除了地表水地下水中被检出8中抗生素外，在居民的饮用水中还检出了四环素、土霉素、金霉素、强力霉素、磺胺二甲基嘧啶、磺胺甲噁唑六种抗生素，含量高的达到了10.82纳克/升，低的也有3.86纳克/升。
王金生称，长时间食用含有这些抗生素的食品之后人体将会产生抗药性，以后再吃这些抗生素有可能难以治愈疾病。
此外，在央视的此次调查中，还曝光了南京部分养鸭人滥用抗生素，称不用药鸭子就容易死亡，自己不吃用药期鸭子生的蛋，也不吃鸭肉。