在人员编制问题上，希望政府有关部门应针对性认真调查研究，建议参照公立学校和乡镇卫生院的模式解决编制问题。
在补偿机制问题上，目前，省级以上资金到位及时，市县级资金缺额较大。县级财政应加大投入，通过直接补偿机制补偿医院，补偿款要及时足额到位。对县新农合资金要有一个合理、统筹预算，在保证医院收入不减少，新农合资金又可承受的基础上，每年合理增长。
在债务风险问题上，政府应在充分调查研究的基础上，尽快启动县级公立医院历史债务化解工作，而不是放任县级医院旧债未偿，又举新债的行为。建议可从以下两方面着手解决：第一，尽快进行新老划断，对历史债务采用适当的途径逐步化解。第二，对今后医院的发展，要科学、合理规划，对合理规划内的基本建设和大型设备由政府出资进行统一采购，从而降低百姓的看病成本，真正让利于民。政府在做到以上两点的同时，不允许医院再举新债，否则，追究当事人责任。
在药品问题上，一是改进药品招投标办法，全程邀请政协委员、人大代表和居民代表参加，对药品招投标各环节都实行监督，以防新的价格水分和违法行为发生。二是政府对提供疗效好、价格低药品的厂家给予适当补偿，以保证顺利供应。另建议逐步统一县级公立医院基本用药目录与新农合基本药品目录、医保基本药品目录。
在人才培养问题上，要建立培训和进修长效机制，医院在经费、工资、绩效考核方面要有政策倾斜，如本院医师到上级医院进修，可根据表现进行绩效考核，发放绩效工资，而不是进修期间马上停发绩效工资。